1 . تهدف ادارة الرقابة المالية ضمان استخدام الموارد المالية بالطريقة الصحيحة والنظامية .
2 . مراقبة الانفاق على بنود الموازنة والإحاطة بمستويات التنفيذ .
3 . التاكد من سلامة الاجراءات المالية فيما يخص موازنة الامانة العامة والحسابات والصناديق .
القيام بمراجعة وتدقيق كافة الإجراءات المالية التي تتم بالأمانة العامة ومكاتب ومراكز وبعثات الجامعة بالخارج .
التأكد إن كافة إن كافة الأمور المالية تتم وفقا للوائح المتبعة للأمانة العامة .
تسهيل مهام الهيئة العليا للرقابة للجامعة المنصوص عليها في ميثاق الأمانة العامة.